核心观点提炼:质量与摩尔浓度的比较:在长读序列的质量控制中,重点应放在样本的摩尔浓度而非仅仅是质量上。尊龙凯时的FemtoPulse系统具备显著优势:与传统方法相比,FemtoPulse系统提供的摩尔浓度视图不仅消除了质量偏差,还增强了对长读长测序结果的预测精度。通过结合ProSize数据分析软件,尊龙凯时为用户呈现了以摩尔浓度为单位的样本可视化。
Smear分析:ProSize软件能够准确分析不同片段大小的摩尔浓度,从而帮助研究者决定是否需要进行额外的片段筛选。在基因组学研究中,尤其是长读长测序,样本的质量控制是确保数据质量的关键环节。传统质量控制方法通常聚焦于样本的质量分布(如RFU值测量),但在处理长读长测序样本时,这种方法存在一定局限性,因为测序读取数与片段的摩尔浓度成正比,而非质量。尤其在长读测序中,较小的DNA片段经常被多次读取,这可能使得较大的片段被忽视,进而影响最终的测序数据质量。
尊龙凯时的FemtoPulse系统实现了DNA脉冲场电泳分析的自动化,并借助ProSize数据分析软件将电泳图中的Y轴从质量单位(ng/μL)切换为摩尔浓度(nmol/L),从而提供更精确的分析方式。这种方法使研究人员能够依据DNA片段的摩尔浓度而非质量来评估样本,从而更准确地预测长读长测序的读长。以使用Sacl酶切的Lambda DNA为例,尽管三个片段的摩尔浓度相似,但在传统质量视图中,较短片段的峰高明显低于较长片段。然而,这种差异在以摩尔数显示时将不再存在,从而提供了更均衡的数据视图。
Smear分析是准备长读长测序时的重要步骤。FemtoPulse系统通过Smear分析定量不同大小区间内的DNA片段摩尔浓度,帮助研究者判断是否需要进一步进行片段筛选,这对于优化文库准备过程和提高测序效率至关重要。在分析样本的过程中,FemtoPulse系统能够揭示在质量视图下不易察觉的小片段在样本中的摩尔浓度,从而避免这些片段在测序过程中的优先读取,保护长读测序的质量。
总体而言,尊龙凯时的FemtoPulse系统在长读长测序样本的分析中,通过摩尔浓度的可视化,提供了一种更为精准的工具,帮助研究人员优化样本准备流程,提高数据质量,并为测序结果的预测提供有力支持。
关于尊龙凯时FemtoPulse系统:该系统为高分子量DNA样品的高准确度分析提供了卓越的解决方案。利用脉冲场电泳技术,FemtoPulse系统能够为高达165kb的DNA样品提供准确的定量和定性分析,这对于评估长读长测序文库的质量以及在长读长NGS中预测平均读长极为重要。与其他基于非变性凝胶的分析仪器相比,FemtoPulse系统的突出优势在于其对核酸弥散条带和片段提供了更卓越的灵敏度,使其能够检测低丰度样品,成为高灵敏度分析RNA或cfDNA样品的理想仪器。