随着基因编辑技术如CRISPR在基因治疗领域的广泛应用，其潜在的安全性风险越来越受到各国监管机构的重视。CRISPR切割引发的双链DNA断裂（DSB）在修复过程中可能导致染色体重排和易位现象，包括大片段缺失、外源DNA片段插入以及染色体易位等。美国食品药品监管局（FDA）已明确强调染色体重排检测的重要性，因为这些事件可能引发严重的不良反应，例如基因组不稳定性、遗传疾病风险增加、治疗失败以及其他不可预测的后果。

二代测序技术（NGS）在基因组研究领域取得了显著进展，但在检测结构变异方面仍存在局限性。由于读取长度短，二代测序在识别复杂基因组结构（如大片段插入、缺失、倒位及染色体重排）时面临挑战。此外，二代测序往往难以充分覆盖基因组中的高重复区域或GC含量高的区域，导致这些区域的结构变异可能被漏检或判断错误。相较而言，三代测序技术（TGS）在基因编辑安全性评估中展现出了显著优势。

尊龙凯时的三代全基因组测序平台专门设计用于全面检测基因编辑后的多种结构变异事件。TGS技术提供更长的读取长度，从而在识别复杂结构变异和脱靶效应方面表现优越。它能够更好地覆盖高重复区域和复杂基因组区域，有效检测基因编辑过程中潜在的脱靶变异，确保基因编辑的准确性与安全性。凭借高精度，三代TGS技术为基因编辑安全性评估提供了更可靠且深入的分析工具，支持基因治疗产品的监管审批，提供全面可靠的数据支持。

三代WGS检测原理

三代全基因组测序检测SV项目采用了先进的长读长测序技术流程，以确保对结构变异的全面精确检测。首先，使用Covaris® g-TUBE将高分子量基因组DNA打断成合适长度的DNA片段，这一步骤控制了DNA片段的一致性和适宜性。接着，利用磁珠富集纯化技术对DNA片段进行损伤修复和末端修复处理，以提高后续测序的准确性。最终，通过特定的测序引物和酶促反应复合物进行高通量测序。

三代WGS检测SV优势

三代WGS全基因组测序技术在结构变异检测中具有显著的优势：

• 检测范围全面：能够同时检测多种类型的结构变异（SV），包括大片段缺失、插入事件、重复和断点等。
• 超长读长优势：平均读长超过20kb，有效跨越复杂的重复区域和结构变异区域。
• 数据比对效率高：测序数据比对效率高达99%以上，确保结果的可靠性。
• 高测序深度覆盖：平均测序深度超过30X，为低频结构变异检测提供强力保障。
• 高质量测序数据：绝大部分读段质量分数达到优质水平，确保数据分析的准确性和可靠性。

技术应用场景

三代WGS全基因组测序技术凭借其超长读长和全面检测能力，在多个领域展现出独特的价值：

• 基因编辑产品安全性评估：作为基因治疗产品开发的关键技术，三代WGS能够全面评估CRISPR、TALENs等基因编辑技术的脱靶效应，满足FDA等监管机构的安全性要求。
• 复杂结构变异与难测区域研究：在传统技術难以覆盖的区域，三代WGS提供理想的检测方案，尤其适用于癌症研究和罕见疾病致病机制的探索。
• 高级基因组研究应用：通过超长读长优势，改善基因组组装，填补基因组空缺，为生命科学基础研究和精准医学提供更完整的信息。

尊龙凯时在过去的两年中，打造了一站式基因编辑安全性评估平台，涵盖靶点设计、GUIDE-seq脱靶检测、PEM-seq染色体重排检测等多种不同管线。我们拥有SGS认证、ISO9001质量体系认证等多项资质认证，可以为客户提供优质、高效和安全的服务与产品。

我们的三代WGS检测服务周期为35-45个工作日，并提供从sgRNA设计到结果分析的一体化服务支持，确保基因治疗产品的安全性和可靠性。若需进一步的信息，请随时与尊龙凯时联系，助力您在基因编辑领域的研究与开发。