尊龙凯时的抗体反应谱（antibody reactome）解析在研究自身免疫疾病、病原免疫、抗原暴露及过敏反应等领域中具有重要价值。该解析不仅有助于生物标志物的发现，有利于临床诊断、疾病治疗的预后评估，同时也为群体水平的免疫研究提供了深入的见解。

噬菌体展示免疫共沉淀测序技术（PhIP-seq）

新兴的噬菌体展示免疫共沉淀测序技术（PhIP-seq）是一种高通量手段，能有效鉴定抗体谱位点及识别抗原信息。这一技术将人为设计的多肽库与高通量DNA合成相结合，将多肽包装于噬菌体并展示在其表面。研究者可通过各种样本中的总抗体进行免疫沉淀，随后对抗体结合的噬菌体的DNA插入片段进行测序，解决相关科学问题。

上海交通大学系统生物医学研究院副院长、抗码生物科技有限公司创始人陶生策教授在《Molecular & Cellular Proteomics》上发表了综述文章，题为“Phage immunoprecipitation and sequencing— a versatile technique for mapping the antibody reactome”，深入总结了PhIP-seq技术的发展历程、现状和未来趋势。

噬菌体展示文库构建与数据分析模型

利用PhIP-seq技术研究的第一步是选择或构建合适的多肽文库。文章详细总结了现有文献报道的各种噬菌体展示肽库，包括人蛋白质组、全人类病毒、冠状病毒、细菌真菌等。这些库能够满足不同研究需求，供科研人员学习参考。

此外，文章还总结了当前的数据分析方法，主要包括两种统计分析模型：计算广义泊松分布和Z-Score计算模型，部分研究还采用伽马泊松分布。近年来，贝叶斯富集估算法作为一种新兴方法也得到了详细介绍。

PhIP-seq技术的应用场景

PhIP-seq技术被广泛应用于以下几个领域：

• 免疫系统失调：该技术能识别与自身免疫疾病、神经退行性疾病、癌症和感染相关的生物标志物，通过血清学检测为临床提供重要价值。
• 确定抗原公共表位：研究免疫系统的抗原表位，为感染性疾病的诊断及其与其他疾病（如肿瘤）的关联提供了新视角。
• 细胞疗法对抗体表位的影响：评估B细胞耗竭疗法的效果。
• 病毒感染性疾病研究：通过VirScan检测患者的自身抗体谱，发现针对特定病毒的特异性抗体。
• 过敏研究：解析IgE和IgG的表位，确定过敏原信息。

此外，PhIP-seq技术在消化道研究及疫苗研究领域的成果也非常丰硕。在大规模队列研究中，PhIP-seq提供的结果为生物信息学和机器学习方法的应用拓展了可能性，比如AVARDA抗病毒抗体反应解卷积算法，能够通过与人源病毒序列比对来评估既往病毒感染史。

PhIP-seq技术展望

不可否认的是，在过去十年中，PhIP-seq技术获得了广泛关注并得到了应用，其发展的标准化将进一步增强其吸引力。我们相信，未来PhIP-seq将更加整合到大规模多组学研究中，这不仅符合生物医学研究的趋势，也是尊龙凯时技术本身的优势所在。

公司介绍

上海抗码芯瑞生物科技有限公司（简称“抗码芯瑞”）由著名教授领导创立，在蛋白组和抗体组研究领域拥有超过20年的深耕经验。公司致力于抗体组学前沿技术的开发与成果转化，建立了噬菌体免疫沉淀测序（PhIP-seq）技术平台，并提供定制化抗原建库服务。抗码芯瑞提供基于PhIP-seq平台的高通量筛选、数据分析及验证等技术服务，为抗体组学研究提供整体解决方案。